洁净室中的灰尘主要来自于工作场所周围的空气中，从而进入到整个工厂或建筑内部。不过，经过调节这些空气很有可能已经达到令所有办公人员和工人感到舒适的程度，这样的级别可以满足洁净区域的非关键性工作的要求。
这一悬浮固体的背景水平一定会增加，其来源正是工作场所中任何可能的污染物，而洁净室内的工作人员是潜在的最大污染源，因为人体在24小时之内掉落的皮肤碎屑有十亿之多。即使是静止站立，一个人每分钟之内也会掉落大约十万个微粒，如果以每小时3千米的速度行走，则每分钟之内掉落的微粒将达到500万。
洁净室的其他污染源包括设备本身（如涂料及其他表面涂层、空调碎屑、洁净室及其内部所有东西的建筑材料）、器具产生的粒子（如润滑剂及加工残渣），以及工作流体和清洁液体（如地板漆面或涂层及化学清洁剂）。化妆品、香水、头发护理产品以及衣服碎屑也是洁净室的污染源。
通过穿着恰当的防护服尽可能地遮挡人体（并且是舒适的），可以最大程度地将人体掉落的微粒隔离在工作场所的空气之外——但是总有微粒掉落，混入其他污染源产生的粒子中。因此洁净室系统必须减少随空气进入室内的污染物，并且同时要减少室内产生的污染，以达到能够符合目前生产过程要求的合适级别。
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